Natural de Almería ejerce de médico en la capital. Durante la Guerra Civil, es trasladado a distintos destinos, como al frente de Iznalloz (Granada) con el cargo de teniente médico. Posteriormente, es trasladado al Hospital Base de Almería, donde ocupa el puesto de director. También es nombrado Presidente del Tribunal Médico de la Caja de Reclutas como capitán médico.

Una vez finalizada la guerra se le inicia proceso judicial militar. A su favor cuenta con multitud de avales: funcionarios de prisiones, falangistas, médicos de varias localidades almerienses o el jefe local de Falange en Garrucha (Almería). Francisco Pérez Rodríguez es condenado a veinte años de prisión.

Cumple condena en la Prisión Provincial de Almería, donde redime pena por el trabajo como auxiliar de medicina. Pasa a la situación de libertad provisional el 26 de abril de 1941 con treinta y tres años de edad.